Calcul scientifique - fouille de données
L’informatique dédiée à l’exploitation intensive de gros volumes de données est principalement liée aux activités de recherches de l’équipe Ondes, activités liées aux méthodes basées sur le bruit ambiant. Cette expertise se situe à l’interface entre les géophysiciens, les spécialistes de HPC et les bases de données dans le cadre de projets nationaux et européens.
Les codes et documentations associées développés dans le cadre de l’activité ’Fouille de données’ sont accessibles dans la Forge OSUG (accès restreint)
– Outils beamforming :documentation et code
– Outils conversion / prétraitement / corrélation : documentation et code
Les expertises métier des personnels techniques impliqués sont :
– Optimisation de codes séquentiels (méthodes numériques, choix des langages, ...)
– Parallélisation d’applications (MPI, OpenMP, make)
– Déploiement d’application
– Calcul sur grille (CiGri v3)
– iRODS : techniques de transfert, gestion des métadata, ...
– IO parallèles
– Traitement du signal : gestion des trous, décimation de données, ...
Contacts pour l’activitié ’Fouille de données’
– Michel Campillo, Philippe Roux, Florent Brenguier : chercheurs, responsable du projet ERC WHISPER, responsable équipe Ondes
– Albanne Lecointre, IR CNRS Informatique, équipe Ondes
Compétences spécifiques
– Python2.7, Fortran95, C
– Octave, Matlab
– Interfaçage Python/Fortran
– Opspy, NumPy
– scan de données : msi
– conversion de format : sac2mseed, win2sac_32
– exploitation de métadonnées : rdseed
– Bibliothèques de calcul scientifique BLAS Lapack, Scipy
– Format de fichiers SEED, NetCDF3
– MPI, OpenMP, make....
– Type de données : sismologiques
Les moyens matériels et logiciels adossés à l’activité ’Fouille de données’
– Lien vers les moyens de calcul CIMENT
– Lien vers les moyens de calcul ISTerre
Moyens logiciel : lien vers le serveur WHISPER ?
Liens avec les autres activités et moyens informatiques à ISterre et à l’OSUG
– Centre de données d’ISterre
– Moyens informatiques du laboratoire
– Centre de stockage OSUG
Lien vers les sites des projets de recherche auxquels participent les membres du groupe ’Fouille de données’
Les projets de recherche liés à l’activité sont
– Projet ERC WHISPER
– Projet européen VERCE
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